Susunan Kabinet Gus Dur - Mega

Mendagri : Suryadi Sudirja

Menlu : Alwi Shihab

Menhankam : Juwono Sudarsono

Menko Polkam: Jenderal Wiranto

Menteri Hukum dan Perundang-undangan : Yusril Ihza Mahendra

Menko Ekuin : Kwik Kian Gie

Menteri Keuangan : Bambang Sudibyo

Mentamben : Susilo Bambang Yudhoyono

Menteri Perindustrian dan Perdagangan : Yusuf Kalla

Menteri Pertanian: M Rakosa

Menteri Kehutanan dan Perkebunan : Nur Mahmudi Ismail

Menteri Perhubungan : Agum Gumelar

Menteri Eksplorasi Kelautan : Sarwono Kusumaatmadja

Menko Kesra Taskim : Hamzah Haz

Menaker : Bomer Pasaribu

Menkes : Ahmad Sujudi

Mendiknas : Yahya Muhaimin

Menteri Agama KH M Tholkah Hasan

Menteri Pemukiman dan pemgembangan wilayah : Erna Witoelar

Menristek : AS Hikam

Menteri Koperasi dan PKM : Zarkasih Nur

Menneg LH : Soni Keraf

Menteri Otonomi Daerah : Ryaas Rasyid

Menteri Pariwisata dan Kesenian : H Hidayat Jaelani

Meninvest : Laksamana Sukardi

Menpora : Mahadi Sinambela

Menteri PU : Dr Ir Sucipto

Menteri UPW : Khofifah Indar Parawansa

Menneg HAM Hasballah M Saad

Menteri Transmigrasi: A Hilal Hamdi

Menpan : Fredy Numberry

Meneg Masalah Kemasyarakatan: Anak Agung Gde Agung

Jaksa Agung : Marzuki Darusman

Panglima TNI : Laksamana Widodo AS

Sekretaris Negara : Ali Rahman